1、穩定性稍差，在150-200℃范圍內，很容易發生磁性轉變，250-550℃范圍內，會出現熱電勢和加熱程序規格變化(回差不一致)，如果長期在高溫下使用，熱電性能不穩定;
2、不適合在真空、碳、硫氣氛中使用;
S型熱電偶的缺點:
1、采用熱電偶，成本高，在所有熱電偶系列中，僅略低于b型熱電偶價格;
2、機械強度差，熱電勢小，特別是在低溫端，熱電偶很小，需要配備高靈敏度的測量儀器;
3、熱電極絲直徑(0.35mm-0.5mm)非常細，機械強度差;
熱電偶測溫的基本原理是兩種不同材料的導體形成一個閉環，
當兩端有溫度梯度時，電流流過回路，兩端之間存在電動勢——熱電動勢，這被稱為塞貝克效應。兩種不同組分的均質導體為熱電極，溫度較高的一端為工作端，溫度較低的一端為自由端，自由端通常處于恒溫狀態。根據熱電動勢與溫度的函數關系，制作了熱電偶分度儀。分度儀是在自由端溫度為0℃的條件下得到的，不同的熱電偶有不同的分度儀。